6 июня Шамиль Атаханов подал в отставку. Он произнес K-News, что это его «добровольное решение». «Я так решил. Пока что буду находиться в вольном плавании. Отдохну. Пройдет какое-то время и, может быть, я прокомментирую предпосылки собственного ухода», - добавил он.

Согласно указу Атамбаева, в согласовании с частью 1 статьи 87 Конституции Кыргызской Республики, частью 5 статьи 13 конституционного Закона Кыргызской Республики «О Правительстве Кыргызской Республики» постановляется:

«Принять отставку члена Правительства Кыргызской Республики Атаханова Шамиля Есенжановича и высвободить его от занимаемой должности вице-премьер-министра Кыргызской Республики».