Как заявил на брифинге прокурор Шота Ткешелашвили, обвинение Мерабишвили предъявлено в связи с фальсификацией хода следствия и препятствия установлению истины деле о убийстве банкира Сандро Гиргвлиани.

В январе 2006 года Сандро Гиргвлиани вкупе со своим другом Леваном Бухаидзе был в кафе «Шарден-бар» в центре Тбилиси. В баре находились глава департамента конституционной сохранности МВД, его заместитель, начальник генеральной инспекции МВД и остальные высокопоставленные чиновники. С одним из их у банкира произошла ссора. В этот же день тело убитого Гиргвлиани было найдено в поселке Окрокана с признаками насильственной погибели.

Трибунал в Грузии вынес приговор по этому делу четверым бывшим высокопоставленным офицерам департамента конституционной сохранности МВД Грузии, которые потом были освобождены по амнистии.
Правозащитные организации страны не раз заявляли о том, что следствие специально скрыло возможную связь преступления с чиновниками МВД.

Мерабишвили уже обвиняется в подкупе избирателей, трате либо присвоении средств с внедрением служебного положения, злоупотреблении возможностями, также превышении возможностей при разгоне акции оппозиции в 2011 году.